banner
Centro de Noticias
Cargado con equipos de primera línea

Acceso general a cubanos como bioisósteros de benceno

Jan 10, 2024

Naturaleza (2023)Citar este artículo

10k Accesos

29 Altmetric

Detalles de métricas

El reemplazo de los anillos de benceno con bioisósteros con hibridación sp3 en candidatos a fármacos generalmente mejora las propiedades farmacocinéticas al mismo tiempo que retiene la actividad biológica1,2,3,4,5. Las estructuras rígidas y tensas, como el biciclo[1.1.1]pentano y el cubano, son particularmente adecuadas, ya que la tensión del anillo imparte una alta fuerza de unión y, por lo tanto, estabilidad metabólica en sus enlaces C–H. Cubane es el bioisóstero ideal ya que proporciona la combinación geométrica más cercana al benceno6,7. En la actualidad, sin embargo, todos los cubanos en el diseño de fármacos, como casi todos los bioisósteros de benceno, actúan únicamente como sustitutos de los anillos de benceno mono o para sustituidos1,2,3,4,5,6,7. Esto se debe a la dificultad de acceder a los precursores de cubano disustituidos en 1,3 y 1,2. La adopción de cubane en el diseño de fármacos se ha visto obstaculizada aún más por la escasa compatibilidad de las reacciones de acoplamiento cruzado con el andamiaje de cubane, debido a una isomerización de valencia catalizada por metales competidora8,9,10,11. Aquí informamos rutas convenientes para bloques de construcción de cubano disustituidos en 1,3 y 1,2 utilizando un precursor de ciclobutadieno conveniente y una reacción de carboxilación C-H fotolítica, respectivamente. Además, aprovechamos la adición oxidativa lenta y la eliminación reductora rápida del cobre para desarrollar protocolos de acoplamiento cruzado C–N, C–C(sp3), C–C(sp2) y C–CF312,13. Nuestra investigación permite la elaboración fácil de todos los isómeros cubanos en candidatos a fármacos, lo que permite el reemplazo bioisotérico ideal de bencenos sustituidos en orto, meta y para.

Esta es una vista previa del contenido de suscripción, acceda a través de su institución

Acceda a Nature y a otras 54 revistas de Nature Portfolio

Obtenga Nature+, nuestra suscripción de acceso en línea de mejor valor

$29.99 / 30 días

cancelar en cualquier momento

Suscríbete a este diario

Reciba 51 ediciones impresas y acceso en línea

$199.00 por año

solo $ 3.90 por número

Alquila o compra este artículo

Obtenga solo este artículo durante el tiempo que lo necesite

$39.95

Los precios pueden estar sujetos a impuestos locales que se calculan durante el pago

Todos los datos están disponibles en el texto principal o en la Información complementaria.

Subbaiah, MAM & Meanwell, NA Bioisósteros del anillo de fenilo: aplicaciones estratégicas recientes en optimización de plomo y diseño de fármacos. J.Med. química 64, 14046–14128 (2021).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Mykhailiuk, PK Bioisósteros saturados de benceno: ¿dónde ir ahora? org. Biomol. química 17, 2839–2849 (2019).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Stepan, AF et al. Aplicación del motivo biciclo[1.1.1]pentano como un bioisóstero de anillo de fenilo no clásico en el diseño de un inhibidor potente y activo por vía oral de la γ-secretasa. J.Med. química 55, 3414–3424 (2012).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Gianatassio, R. et al. Aminación por liberación de tensión. Ciencia 351, 241–246 (2016).

Artículo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Zhang, X. et al. Síntesis mediada por cobre de biciclopentanos similares a fármacos. Naturaleza 580, 220–226 (2020).

Artículo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Eaton, PE Cubanes: materiales de partida para la química de los 90 y el nuevo siglo. Angew. química En t. ed. 31, 1421–1436 (1992).

Artículo Google Académico

Reekie, TA, Williams, CM, Rendina, LM & Kassiou, M. Cubanes en química médica. J.Med. química 62, 1078–1095 (2019).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Cassar, L., Eaton, PE y Halpern, J. Isomerizaciones de cubano catalizadas por plata (I) y paladio (II). Síntesis y caracterización de cuneane. Mermelada. química Soc. 92, 6366–6368 (1970).

Artículo Google Académico

Cassar, L., Eaton, PE y Halpern, J. Catálisis de reacciones restringidas por simetría mediante compuestos de metales de transición. La isomerización de valencia del cubano. Mermelada. química Soc. 92, 3515-3518 (1970).

Artículo CAS Google Académico

Plunkett, S., Flanagan, KJ, Twamley, B. y Senge, MO Andamios sp3 terciarios altamente tensos: síntesis de cubanos funcionalizados y exploración de su reactividad bajo catálisis de Pd (II). Organometálicos 34, 1408–1414 (2015).

Artículo CAS Google Académico

Toriyama, F. et al. Ésteres activos redox en el acoplamiento C-C catalizado por Fe. Mermelada. química Soc. 138, 11132–11135 (2016).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Le, C., Chen, TQ, Liang, T., Zhang, P. y MacMillan, DWC Un enfoque radical del problema de la adición oxidativa del cobre: ​​trifluorometilación de bromoarenos. Ciencia 360, 1010–1014 (2018).

Artículo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Liang, Y., Zhang, X. & MacMillan, DWC Acoplamiento descarboxilador sp3 C–N mediante catálisis dual de cobre y fotorredox. Naturaleza 559, 83–88 (2018).

Artículo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Lovering, F., Bikker, J. & Humblet, C. Escape from flatland: aumentar la saturación como enfoque para mejorar el éxito clínico. J.Med. química 52, 6752–6756 (2009).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Feng, Y., Liu, L., Wang, J.-T., Zhao, S.-W. & Guo, Q.-X. Energías de disociación de enlaces homolíticos C-H y N-H de compuestos orgánicos tensos. J. Org. química 69, 3129–3138 (2004).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Levterov, VV, Panasyuk, Y., Pivnytska, VO y Mykhailiuk, PK Miméticos de benceno no clásicos solubles en agua. Angew. química En t. ed. 59, 7161–7167 (2020).

Artículo CAS Google Académico

Denisenko , A. , Garbuz , P. , Shishkina , SV , Voloshchuk , NM & Mykhailiuk , PK Bioisosteres saturados de bencenos sustituidos en orto . Angew. química En t. ed. 59, 20515–20521 (2020).

Artículo CAS Google Académico

Zhao, J.-X. et al. Biciclo[1.1.1]pentanos 1,2-difuncionalizados: miméticos largamente buscados para arenos sustituidos en orto/meta. proc. Academia Nacional. ciencia EE. UU. 118, e2108881118 (2021).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Epplin, RC y col. [2]-Ladderanes como isósteros para anillos aromáticos sustituidos en meta y ciclohexanos rigidificados. Nat. común 13, 6056 (2022).

Artículo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Iida, T. et al. Acceso práctico y fácil a biciclo[3.1.1]heptanos: potentes bioisósteres de bencenos meta-sustituidos. Mermelada. química Soc. 144, 21848–21852 (2022).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Kleinmans, R. et al. [2π+2σ]-fotocicloadición intermolecular habilitada por transferencia de energía triplete. Naturaleza 605, 477–482 (2022).

Artículo ADS CAS PubMed Google Scholar

Frank, N. et al. Síntesis de bioisósteros de areno sustituidos en meta a partir de [3.1.1]propelano. Naturaleza 611, 721–726 (2022).

Artículo ADS CAS PubMed Google Scholar

Rigotti, T. & Bach, T. Biciclo[2.1.1]hexanos mediante fotocicloadiciones intramoleculares cruzadas [2+2] impulsadas por luz visible. org. Letón. Rev. 24, 8821–8825 (2022).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Eaton, PE y Cole, TW Cubane. Mermelada. química Soc. 86, 3157–3158 (1964).

Artículo CAS Google Académico

Falkiner, MJ, Littler, SW, McRae, KJ, Savage, GP y Tsanaktsidis, J. Producción a escala piloto de 1,4-cubanodicarboxilato de dimetilo. org. Resolución de proceso desarrollo 17, 1503-1509 (2013).

Artículo CAS Google Académico

Biegasiewicz, KF, Griffiths, JR, Savage, GP, Tsanaktsidis, J. & Priefer, R. Cubane: 50 años después. química Rev. 115, 6719–6745 (2015).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Kassiou, M., Coster, M. & Gunosewoyo, H. Compuestos moleculares policíclicos. Patente WO2008064432A1 (2008).

Wlochal, J., Davies, RDM & Burton, J. Cubanes en química médica: síntesis de bloques de construcción funcionalizados. org. Letón. 16, 4094–4097 (2014).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Chalmers, BA et al. Validación de la hipótesis de Eaton: cubano como bioisóstero de benceno. Angew. química En t. ed. 55, 3580–3585 (2016).

Artículo CAS Google Académico

Houston, SD et al. El paradigma cubano en el descubrimiento de moléculas bioactivas: mayores alcances, limitaciones y el complemento ciclooctatetraeno. org. Biomol. química 17, 6790–6798 (2019).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Bernhard, SSR et al. Acoplamiento cruzado cubano y arreglos de cubano-porfirina. química EUR. J. 24, 1026–1030 (2018).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Okude, R., Mori, G., Yagi, A. & Itami, K. Síntesis programable de cubanos arilados múltiples a través de metalación y arilación C-H. química ciencia 11, 7672–7675 (2020).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Barborak, JC, Watts, L. & Pettit, R. Una síntesis conveniente del sistema cubano. Mermelada. química Soc. 88, 1328–1329 (1966).

Artículo CAS Google Académico

Brewer, CR, Sheehan, NC, Herrera, J., Walker, AV y McElwee-White, L. Fotoquímica de complejos (η4-dieno)Ru(CO)3 como candidatos precursores para la deposición de vapor químico fotoasistida. Organometálicos 41, 761–775 (2022).

Artículo CAS Google Académico

Pettit, R. & Henery, J. Cyclobutadieneiron tricarbonyl. org. sintetizador 50, 57–59 (1970).

Google Académico

Masamune, S., Nakamura, N. y Sapadaro, J. 1,2-bis(β-tosiletoxicarbonil)diazeno. Su aplicación al sistema 2,3-diazabiciclo[2.2.0]hexeno. Mermelada. química Soc. 97, 918–919 (1975).

Artículo CAS Google Académico

Britten, TK, Akien, GR, Kemmitt, PD, Halcovitch, NR & Coote, SC Una preparación eficiente de 1,2-dihidropiridazinas a través de una secuencia de eliminación catalizada por Diels-Alder/paladio. tetraedro Lett. 60, 1498–1500 (2019).

Artículo CAS Google Académico

Altman, LJ, Semmelhack, MF, Hornby, RB & Vederas, JC Isomerización fotoquímica de dimetil 1,2-dihidropiridazina-1,2-dicarboxilato. química común 1968, 686–687 (1968).

Google Académico

Britten, TK, Kemmitt, PD, Halcovitch, NR y Coote, SC 4-π-Fotociclación de 1,2-dihidropiridazinas: un enfoque de las 1,2-diazetidinas bicíclicas con un rico potencial sintético. org. Letón. 21, 9232–9235 (2019).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Bashir-Hashemi, A. Carboxilación fotoquímica de cubanos. Angew. química En t. ed. 32, 612–613 (1993).

Artículo Google Académico

Collin, DE, Kovacic, K., Light, ME y Linclau, B. Síntesis de derivados de 1,4-cubandicarboxilato ortofuncionalizados mediante clorocarbonilación fotoquímica. org. Letón. 23, 5164–5169 (2021).

Artículo CAS Google Académico

Chan, AY et al. Metallaphotoredox: la fusión de fotoredox y catálisis de metales de transición. química Rev. 122, 1485–1542 (2022).

Artículo CAS PubMed Google Académico

Rodríguez, N. & Gooßen, LJ Reacciones de acoplamiento descarboxilador: una estrategia moderna para la formación de enlaces C–C. química Soc. Rev. 40, 5030–5048 (2011).

Artículo PubMed Google Académico

Ruiz-Castillo, P. & Buchwald, SL Aplicaciones de las reacciones de acoplamiento cruzado C–N catalizadas por paladio. química Rev. 116, 12564–12649 (2016).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Hartwig, JF Evolución de un catalizador de cuarta generación para la aminación y tioeterificación de haluros de arilo. Cuenta química Res. 41, 1534-1544 (2008).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Zhao, W., Wurz, RP, Peters, JC & Fu, GC Acoplamiento C−N descarboxilante catalizado por cobre fotoinducido para generar aminas protegidas: una alternativa al reordenamiento de Curtius. Mermelada. química Soc. 139, 12153–12156 (2017).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Sodano, TM, Combee, LA & Stephenson, CRJ Avances recientes y perspectivas para el reemplazo isostérico de anilinas. ACS Med. química Letón. 11, 1785–1788 (2020).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Sklyarova, AS et al. Preparación y ensayo de homocubilaminas como antagonistas terapéuticos del receptor NMDA. Medicina. química Res. 22, 360–366 (2013).

Artículo CAS Google Académico

Sakai, HA, Liu, W., Le, C. y MacMillan, DWC Acoplamiento de electrófilos cruzados de cloruros de alquilo inactivados. Mermelada. química Soc. 142, 11691–11697 (2020).

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Descargar referencias

Agradecemos a Z. Dong, P. Sarver, Y. Liang, C. Oswood, W. Liu y M. Heilmann por los debates; I. Pelcer y K. Conover por su ayuda con la espectroscopia de RMN; R. Lambert por su asistencia en la preparación de este documento; J. Piesvaux, JP Imredy, RL Kraus y B. Lacey por su ayuda con el perfil biológico; y A. Beard, M. Darlak, S. McMinn, L. Nogle, M. Pietrafitta, D. Smith y Y. Ye (todos de Merck & Co., Inc.) por su ayuda con la cromatografía de fase inversa. La investigación fue apoyada por el Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales (NIGMS) de los NIH, los NIH (R35GM134897-03), la Iniciativa de Catálisis de Princeton y amables obsequios de Merck & Co., Inc., Bristol-Myers Squibb (BMS), Celgene, Genentech, Janssen Research and Development LLC y Pfizer. MPW recibió el apoyo de la Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina (LPDS 2018-16). FB fue financiado por la German Research Foundation (DFG) – 421436809, y JD fue apoyado por una beca de SNSF Early Postdoc.Mobility.

Estos autores contribuyeron igualmente: Mario P. Wiesenfeldt, James A. Rossi-Ashton, Ian B. Perry

Merck Center for Catalysis en la Universidad de Princeton, Princeton, NJ, EE. UU.

Mario P. Wiesenfeldt, James A. Rossi-Ashton, Ian B. Perry, Johannes Diesel, Olivia L. Garry, Florian Bartels y David WC MacMillan

Universidad de Lancaster, Lancaster, Reino Unido

Susannah C. Coote

Departamento de Química de Descubrimiento, Merck & Co., Inc., Boston, MA, EE. UU.

Xiaoshen Ma, Charles S. Yeung y David J. Bennett

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

También puede buscar este autor en PubMed Google Scholar

MPW e IBP desarrollaron la ruta hacia el dimetilcubano-1,3-dicarboxilato. OLG, MPW y JAR-A. desarrolló la ruta hacia el 1-terc-butil-2-metilcubano-1,2-dicarboxilato. JAR-A. e IBP desarrollaron la reacción de aminación, JD y MPW desarrollaron la reacción de alquilación, MPW, FB y JD desarrollaron la reacción de arilación y JAR-A. y FB desarrolló la reacción de trifluorometilación. JAR-A. aplicó las reacciones a nuevos isómeros cubanos y sintetizó los análogos de fármacos. Las pruebas biológicas fueron realizadas por XM, CSY y DJBDWCM, SCC, XM, CSY y DJB brindaron asesoramiento. DWCM, MPW, JAR-A., IBP y JD escribieron el documento con contribuciones de todos los autores. DWCM dirigió el proyecto.

Correspondencia a David WC MacMillan.

DWCM declara un interés de propiedad en el fotorreactor Penn PhD, que se utiliza para irradiar reacciones en este trabajo. Los demás autores declaran no tener intereses contrapuestos.

Nature agradece a Kaid Harper y a los otros revisores anónimos por su contribución a la revisión por pares de este trabajo.

Nota del editor Springer Nature se mantiene neutral con respecto a los reclamos jurisdiccionales en mapas publicados y afiliaciones institucionales.

Este archivo contiene información general, procedimientos experimentales, datos de caracterización, información ampliada, figuras complementarias. 1–36, espectros de RMN y referencias.

Springer Nature o su licenciante (p. ej., una sociedad u otro socio) posee los derechos exclusivos de este artículo en virtud de un acuerdo de publicación con los autores u otros titulares de derechos; el autoarchivo del autor de la versión manuscrita aceptada de este artículo se rige únicamente por los términos de dicho acuerdo de publicación y la ley aplicable.

Reimpresiones y permisos

Wiesenfeldt, MP, Rossi-Ashton, JA, Perry, IB et al. Acceso general a cubanos como bioisósteros de benceno. Naturaleza (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-06021-8

Descargar cita

Recibido: 20 enero 2023

Aceptado: 27 de marzo de 2023

Publicado: 04 abril 2023

DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06021-8

Cualquier persona con la que compartas el siguiente enlace podrá leer este contenido:

Lo sentimos, un enlace para compartir no está disponible actualmente para este artículo.

Proporcionado por la iniciativa de intercambio de contenido Springer Nature SharedIt

Al enviar un comentario, acepta cumplir con nuestros Términos y Pautas de la comunidad. Si encuentra algo abusivo o que no cumple con nuestros términos o pautas, márquelo como inapropiado.